Внутренняя статистика переходов учитывается по реферальным ссылкам и ссылкам с UTM метками. Просто переходы по обычной ссылке сайта не учитываются. Для этого есть сервис Яндекс.Метрика (и другие счетчики), которую вы можете установить на свой сайт.

Может быть интересно